战后复兴的东京，、少年侦探金田正太郎和他的“铁人28号”一起解决了一个接着一个的困难事件。但是在战争中行踪不明的正太郎的哥哥出现在了正太郎面前。（正太郎的哥哥也叫正太郎，故下面用SHOUTAROU代替）。为了战争而接受铁人操控训练…

F.C.未来世纪59年，各个卫星之间的主导权由每四年一届的GUNDAM FIGHTER大会的优胜者来决定。Neo JAPAN的代表火洲土门出战GUNDAM FIGHTER大会的真正目的，是为了打倒被魔鬼敢达所控制的哥哥、以及幕后策划者-自己的师父东方不败。