过去曾发生过战争。战后被称为“极光战争”的这场战乱，是发生在塞雷斯提亚和茵费利亚之间的战争。战争结束之后茵费利亚和塞雷斯提亚便断绝交流，一直到今天。而现在两个世界面临即将灭亡的命运。挺身而出来拯救这场危机的，却是一群无名…

爱德华·爱力克和他的弟弟阿尔冯斯十分思念亡故的母亲，为了再次见到母亲的微笑，而进行炼金术中最大的禁忌－－人体炼成，欲将死者复活的炼成术。可是炼成失败时的反弹效应，爱德付出“通行费”左脚、阿尔则失去全身。为救回弟弟，爱德牺…